A região onde se encontra o município era de propriedade do Sr. Pio Martins de Almeida, no inicio as principais famílias da região eram vindos de Goiás (Mineiros), São Paulo e de Minas Gerais. O fundador do município Sr Alcino Fernandes Carneiro adquiriu o quinhão terras e o município de Alcinópolis começou a ser povoado em 8 de outubro de 1975 com o intuito de facilitar as condições de vida das pessoas que moravam nas fazendas.

Para tanto a maior prioridade estava na educação, onde fazendeiros com ideias de estudar seus filhos, numa região com grandes dificuldades de acesso ao progresso contratavam professores particulares. A educação foi neste sistema nas décadas de 40, 50, 60 e 70. Em 1977, o sul de Mato Grosso é desmembrado para dar origem ao atual estado de Mato Grosso do Sul, a qual Alcinópolis faz parte atualmente. Em 22 de abril de 1992, pela lei número 1.262, foi criado o Município de Alcinópolis, pelo, então, governador Pedro Pedrossian, ficando o mesmo pertencendo a Comarca de Coxim.